0.01%阿托品和托吡卡胺都是散瞳药物，用于眼科检查和治疗某些眼科疾病。两者的主要区别在于作用时间和用途：

1. 作用时间：0.01%阿托品的作用时间较长，通常持续 1-2 天，而托吡卡胺的作用时间较短，通常持续 4-6 小时。

2. 用途：0.01%阿托品主要用于青少年近视防控，以及葡萄膜炎、白内障等疾病的治疗；托吡卡胺主要用于眼科检查，如散瞳验光、眼底检查等，也可用于治疗某些眼科疾病，如葡萄膜炎、眼肌麻痹等。

需要注意的是，使用散瞳药物时应遵循医生的建议，避免自行使用。