免费两癌筛查与自费筛查的主要区别在于筛查的覆盖人群、筛查项目和费用承担方式等。

首先，免费两癌筛查是国家针对农村妇女的公益项目，而自费筛查没有特定的对象限制，任何人都可以进行。其次，免费两癌筛查主要针对的是宫颈癌和乳腺癌，而自费筛查可以涵盖更多的癌症种类。最后，免费两癌筛查的费用由政府承担，而自费筛查的费用由个人承担。

免费两癌筛查是中国政府为了减少农村妇女的两癌（宫颈癌和乳腺癌）发病率和死亡率，实施的一项公益健康项目。筛查对象主要是农村地区的35-64岁妇女，包括液基细胞学检查和临床乳腺检查两项。

自费筛查则是个人根据自身的需求和经济能力，自主选择的健康筛查项目。除了宫颈癌和乳腺癌，还可以包括肺癌、胃癌、结直肠癌等多种癌症的筛查。费用由个人承担，根据不同的筛查项目和医疗机构，费用也会有所不同。

两者的选择取决于个人的经济能力、健康需求和风险评估。如果有条件，建议定期进行全面的健康筛查，早期发现、早期治疗，以减少癌症带来的健康威胁。