细菌性毛囊炎和马拉色菌毛囊炎的区别主要体现在病因、临床表现、以及治疗方式上。

首先，两者的病因不同。细菌性毛囊炎是由细菌感染，病原体主要是凝固酶阳性金黄色葡萄球菌，而马拉色菌毛囊炎则是由马拉色菌引起的，马拉色菌是人体正常寄生菌，在促发因素影响下会大量繁殖而发病。

其次，两者的临床表现也有所区别。马拉色菌毛囊炎典型皮损为炎性毛囊性丘疹、丘疱疹或小脓疱，半球形，直径2～4mm，周边有红晕，可挤出粉脂状物质，常数十至数百个密集或散在分布。

而细菌性毛囊炎基本损害是毛囊丘疹，初为毛囊口炎性丘疹或小脓疱，中间有毛发穿过，周围有炎性红晕。

最后，治疗方面，马拉色菌毛囊炎需要使用抗真菌药物，细菌性毛囊炎的治疗根据病情选用适当的抗生素。

因此，虽然两者在病症表现上有相似之处，但在病因、治疗方式上有明显区别，需要通过医学检查才能准确诊断。