长期凌晨三点起床工作可能对身体造成睡眠质量下降、生物钟紊乱、心脑血管疾病风险增加和免疫力降低四方面的影响。

首先，由于人的生物钟习惯于在夜晚休息，长期在凌晨起床工作会导致睡眠时间减少，从而影响睡眠质量，可能出现疲劳、注意力不集中等症状。

其次，人体内部有一种称为生物钟的机制，它控制着人体的许多生理功能，如体温、荷尔蒙分泌等，与人的生活规律密切相关。长期凌晨三点起床工作会干扰这种生物钟的正常运行，可能会出现精神压力、情绪波动等问题。

再者，长期凌晨起床工作，导致睡眠不足、生物钟紊乱会增加心脑血管疾病的风险。

最后，长期凌晨起床工作导致睡眠不足可能会降低免疫力。良好的睡眠可以提高免疫系统的功能，而缺乏足够的睡眠会降低免疫力，增加感染疾病的风险。

综上，长期凌晨三点起床工作对身体的影响主要表现在睡眠质量下降、生物钟紊乱、心脑血管疾病风险增加和免疫力降低等方面，需要注意保持充足的休息，合理调整作息时间。