使用双氧水消毒时会感到疼痛，原因包括化学反应引起的物理刺激、双氧水对健康组织的刺激和神经末梢的痛感反应。

1.化学反应引起的物理刺激：双氧水是一种强氧化剂，与伤口接触时会迅速分解生成氧气，氧气的快速产生和释放可以造成物理性刺激，导致疼痛感。

2.双氧水对健康组织的刺激：双氧水不仅可以杀灭伤口中的病菌，也可能损害周围的健康组织，这种刺激也会引起疼痛。

3.神经末梢的痛感反应：伤口处的神经末梢在刺激下会产生痛感反应，双氧水的刺激可能导致神经末梢更敏感，从而感到疼痛。

虽然双氧水可以用于初步清洁伤口，但因其对健康组织的刺激性，长期或大面积使用双氧水可能延缓伤口愈合。在处理伤口时，建议在医生指导下正确使用消毒药物。