阜外医院和安贞医院的主要区别在于它们的专业特色和发展方向。阜外医院以心血管疾病的诊疗为主，而安贞医院则以呼吸系统疾病和胸外科手术为特色。

1.阜外医院全名北京阜外心血管病医院，成立于1956年，是中国最早的心血管病专科医院之一，也是世界著名的心血管病治疗中心。

2.阜外医院在心血管疾病的诊疗、科研、教学等方面具有很高的声誉和水平，特别是在心血管疾病的介入治疗、外科手术和心脏移植等方面具有国内外领先地位。

3.安贞医院全名北京安贞医院，成立于1955年，原为中国人民解放军总医院的附属医院，现已成为北京市重点支持的市属三级甲等综合性医院。

4.安贞医院以呼吸系统疾病和胸外科手术为特色，如支气管哮喘、慢性阻塞性肺疾病、肺癌等。同时，安贞医院还在其他领域如消化、肾脏、神经内科等方面具有较高的诊疗水平。

总之，阜外医院和安贞医院各自具有特色，分别在心血管和呼吸领域有着较高的诊疗水平。根据患者的具体病情，选择相应的专科医院进行就诊。