男性生殖器根部长了个痘痘按压会痛可能与毛囊炎、龟头炎、尖锐湿疣等有关。

1.毛囊炎：可能是由于生殖器根部皮肤受损，出现细菌等感染。导致局部出现皮损多为红色丘疹，触碰时会有疼痛感觉。

2.龟头炎：通常是由免疫功能低下、病原体感染、频繁清洗等原因所导致，龟头蔓延到生殖器根部皮肤会出现红斑、丘疹等情况，伴有触摸痛。

3.尖锐湿疣：通常是生殖器根部感染人乳头瘤病毒所导致，多与免疫系统出现问题、无安全措施的性行为等有关。皮损多为淡红色颗粒，后期形状多呈乳头状、鸡冠状等，表面还可能会出现破溃、糜烂等情况，有触摸痛的情况。

男性生殖器根部长了个痘痘按压会痛还可能见于湿疹、生殖器疱疹等原因，如果症状较严重，建议及时就医，遵医嘱规范治疗。