南瓜藤和丝瓜藤的药用部位、性味归经、功效主治都有区别。

南瓜藤为葫芦科南瓜属植物南瓜的茎，味甘、苦，性凉，归肝、胃、肺经。其具有清肺、平肝、和胃、通络的功效，用于肺痨低热，肝胃气痛，月经不调，目赤肿痛，水火烫伤。

丝瓜藤为葫芦科丝瓜属植物丝瓜的茎，味苦，性微寒归心、脾、肾经。其具有舒筋活血、止咳化痰的功效，用于腰膝酸痛，肢体麻木，月经不调，咳嗽痰多，鼻渊（主要表现为鼻涕秽浊，量多擦不干净），牙宣，龋齿。

南瓜藤和丝瓜藤的不良反应和禁忌尚不明确，如有用药需求，建议在专业医师辨证指导下使用，不可盲目自行用药。