宝宝头顶凹陷有个坑，可能和生理因素、外伤有关，也有可能是缺乏维生素D或者是钙导致的佝偻病等因素有关。

1.生理因素：宝宝由于年龄比较小，所以颅骨结合不紧密所形成的颅骨凹陷，这种是正常的生理现象，随着宝宝年龄发展会慢慢的改善。

2.外伤：宝宝头顶凹陷有个坑，也可能是由于外伤导致，特别是有头碰过一些硬物等情况。

3.佝偻病：宝宝出现以上情况可能和佝偻病有关，一般在缺乏维生素D和钙的时候，如果没有及时的补充，可能会出现佝偻病。

宝宝头顶凹陷有个坑，还可能和先天性遗传等其他因素有关，建议及时到医院进行相关的检查，明确病因之后积极对症治疗。