引起患者二脚趾根部和脚掌连接处疼痛的原因主要是风湿性关节炎、腱鞘炎、普通发炎、跖痛症等。

1.风湿性关节炎:是游走性多发性的关节炎，局部可出现红、肿、灼热、疼痛和压痛，有时有渗出，但无化脓现象。疼痛一般不足一个月，常反复。发生在二脚趾根部关节处也会感到疼痛。

2.腱鞘炎:主要表现是局部的疼痛、压痛、受累关节活动受限。部分患者还伴有放射痛，即自腱鞘病变处向肢体末端放射。会发生在部分患者二脚趾根部。

3.其他炎症:二脚趾根部和脚掌连接处由于挤压摩擦、鞋子不透气等发炎，常出现红肿，发热，疼痛。

4.跖痛症:鞋子太硬，鞋底有弧度等原因使得脚底应力增加引起的前足跖趾关节跖侧的疼痛表现为跖骨部位的疼痛，主要可能伴随肿胀和发热。

二脚趾根部和脚掌连接处疼痛还有很多病因，建议到医院就诊，明确诊断及治疗方案，避免自行盲目用药。