细胞产物有很多，分为初级代谢产物及次级代谢产物。

细胞产物是由细胞新陈代谢产生的，部分具有免疫、调节、内分泌等功能。像胃蛋白酶、甲状腺激素等都属于细胞代谢产物。

初级代谢产物有脂类、维生素、核苷酸、多糖及氨基酸等，它们是微生物代谢产生的满足自身生长繁殖的必需物质。而次级代谢产物主要包括各种激素、抗生素、色素及毒素等，这些物质的结构相对复杂一些。