扁平疣彻底根除的方法是外用药物、物理治疗、手术治疗。

1.扁平疣和人乳头瘤病毒感染有一定的关系，治疗扁平疣可以选择外用药物，可以局部涂抹水杨酸，水杨酸具有腐蚀的作用，能够使疣体脱落。

2.还可以通过一些物理的方法治疗，比如激光、冷冻、电灼、刮除等，可以采用脉冲染料激光，通过高温使皮损组织坏死脱落，也可以使用液氮产生低温使皮损坏死脱落，还可以用特制的刮匙刮除皮损。

3.扁平疣手术的方法是自体疣免疫疗法，通过手术的方法将自体疣植入上臂三角肌下，刺激机体释放细胞因子，然后清除表皮上的人乳头瘤病毒。

扁平疣去除以后容易出现复发，和患者免疫力低有一定的关系，所以如果想彻底的根除扁平疣，平时要多锻炼身体，提高身体的免疫力。建议到正规医疗机构就医，接受规范治疗。